18 sierpnia 1886 JULIA LEDÓCHOWSKA wstępuje do klasztoru urszulanek w Krakowie. W 1887 rozpoczyna nowicjat i przyjmuje imię zakonne: Maria Urszula. 28 kwietnia 1889 roku składa profesję wieczystą. W oczekiwaniu na dzień ślubów pisze: "Z tęsknotą wyglądam tego dnia szczęśliwego, który ma na zawsze połączyć mnie z Jezusem moim. Żebym tylko miłować umiała! Palić, spalać się miłością..."

Pracuje jako nauczycielka i wychowawczyni w szkole prowadzonej przez siostry, ceniona i kochana przez młodzież. Uzupełnia swe przygotowanie pedagogiczne. Bierze lekcje malarstwa i ozdabia klasztor malowidłami ściennymi i obrazami. W 1904 zostaje przez wspólnotę wybrana przełożoną klasztoru krakowskiego. W tym okresie, dzięki jej staraniom, powstaje przy klasztorze pierwszy internat dla studentek uczelni krakowskich i pierwsza w Polsce Sodalicja Mariańska akademiczek. W 1907 roku odbywa podróż do Rzymu w sprawie zmian w Konstytucjach klasztoru i przyjęta zostaje na audiencji przez Ojca św. Piusa X.